Принцип действия установки прост. В биореактор подаётся сырьё — как правило, навоз. Кроме него используют солому, ил сточных вод, траву, просроченные продукты. Далее отходы проходят процесс разложения под действием микробов. Для большей эффективности масса подогревается и перемешивается миксером. Питаясь отходами, микробы выделяют газ, который собирается и используется для собственных нужд.
Стоит отметить, что расход биогаза больше, чем обычного, но, с другой стороны, он менее удушливый. Те хозяйства, которые имеют слишком много отходов, сжигают часть полученного топлива для получения электричества, которое продают по «зелёному тарифу». Некоторые умельцы даже собирают БГУ своими руками, но это слишком рискованно: в случае неточностей в конструкции газ может стать причиной происшествий.